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Cómo conseguir una búsqueda de secuencias IP más completa, rápida y eficaz

Cómo conseguir una búsqueda de secuencias IP más completa, rápida y eficaz

Cómo conseguir una búsqueda de secuencias IP más completa, rápida y eficaz

Sep 28, 2021

Henk Heus
Blue test tube

Cualquiera que haya realizado una búsqueda de secuencias de IP puede decir que no es fácil. Hay que abarcar todos los datos relevantes, asegurarse de que se buscan los datos de forma correcta y manejar los resultados de forma eficiente y eficaz. Además, hay que mantener la confidencialidad. No hacer todo esto puede afectar negativamente a los resultados y las conclusiones, lo que en última instancia conduce a decisiones empresariales erróneas.

Así que, teniendo esto en cuenta, ¿qué medidas puede tomar para evitar que esto ocurra?

Haga una búsqueda lo más exhaustiva posible

El mayor reto en la búsqueda de secuencias de PI es encontrar una fuente fiable, completa y actualizada de información sobre patentes. La base de datos de secuencias de P.I. que elija debe incluir los países más difíciles de obtener, así como incluir secuencias en tablas y figuras. Por ejemplo, en marzo de 2021, la Lens contiene unos 375 millones de secuencias, mientras que GQ-Pat, La base de datos de secuencias de PI de Aptean GenomeQuest , contiene 495 millones de secuencias. Es decir, 120 millones de secuencias más.

Para responder a las preguntas críticas para el negocio, hay que asegurarse de que se trabaja con una fuente de información completa, que se actualiza continuamente con flujos de datos de las oficinas de patentes de todo el mundo, y que incluye las partes utilizables de bases de datos como GenBank, EMBL y DDBJ.

Asegúrese de buscar de la manera correcta

No hace falta decir que los resultados de búsqueda objetivos y repetibles son importantes en la PI. Desgraciadamente, muchos de los algoritmos de búsqueda de secuencias más conocidos distan mucho de ser ideales para las cuestiones relacionadas con la propiedad intelectual, ya que muchos prefieren utilizar sólo una parte de la secuencia de la consulta si eso significa que pueden informar de un mayor porcentaje de identidad. Restringir la longitud de la alineación a un par de residuos casi siempre producirá un 100% de identidad entre dos secuencias cualquiera, pero no necesariamente responde a su consulta específica. Algunas de estas soluciones tampoco informan necesariamente de todos los alineamientos encontrados, utilizando un complicado modelo estadístico que decide si una coincidencia es significativa o no. Además, cuando la base de datos crece, pueden desaparecer elementos encontrados en el pasado.

Para superar estos problemas, Aptean GenomeQuest desarrolló y publicó el algoritmo de "porcentaje de identidad" de GenePast. Este algoritmo alinea toda la secuencia de consulta minimizando el número de desajustes, inserciones y supresiones. No utiliza un modelo estadístico ni atajos de algoritmos, por lo que siempre produce una lista objetiva y completa de los mejores resultados posibles, independientemente del tamaño de la base de datos o del alineamiento.

Asegurar las respuestas de forma inmediata

Con demasiada frecuencia, las aplicaciones de búsqueda de secuencias presentan los resultados como una lista larga y estática de alineaciones, lo que dificulta el filtrado de la información relevante. Es posible que acabe imprimiendo todo, repasando los resultados uno por uno y buscando información de patentes relacionada en línea, una solución que lleva mucho tiempo, es propensa a errores y es inflexible.

En su lugar, necesita que los resultados de la búsqueda se presenten como una lista interactiva, que contenga información sobre las alineaciones, las secuencias y los documentos de PI relacionados, incluyendo las fechas importantes, el título de la patente, el resumen, las reivindicaciones, el cesionario, la clasificación y la situación jurídica de un documento. A continuación, puede agrupar todas las alineaciones por número de patente y familia de patentes para ver juntos todos los resultados relacionados, pudiendo ajustar y ampliar los análisis de resultados a voluntad. Esto le permite obtener respuestas en minutos en lugar de días o semanas, lo que le permite realizar más búsquedas en una fase más temprana del ciclo de desarrollo del producto, así como liberar a los especialistas en búsquedas y a los abogados de patentes para que realicen otras tareas.

Mantener la confidencialidad

La confidencialidad de la búsqueda de IP es clave, algo que no se puede garantizar con un servicio público. La elección de la solución de búsqueda adecuada garantizará que todos sus datos se manejen y almacenen en una red privada segura, con la comunicación entre su navegador y los servidores del proveedor totalmente encriptada con protección de contraseña para su cuenta de usuario.

Para lograr una búsqueda de secuencias IP completa, más rápida y eficiente, se necesita una base de datos exhaustiva y actualizada, que utilice los algoritmos y parámetros adecuados para el trabajo y una forma eficiente de refinar una lista de resultados de búsqueda en respuestas precisas a sus preguntas.

En las dos últimas décadas, Aptean GenomeQuest ha sido utilizado por muchas de las mayores empresas farmacéuticas, biotecnológicas y agrícolas del mundo, así como por bufetes de abogados y oficinas de patentes especializadas, para proteger su propiedad intelectual.

Cuando se trata de proteger su propiedad intelectual, póngase en contacto hoy mismo con para saber cómo puede ayudarle Aptean GenomeQuest.

Háblanos de ti y un especialista de Aptean se pondrá en contacto contigo.